第二季故事中，主角馬神彈的夢(mèng)想是在卡片戰(zhàn)斗游戲“Battle Spirits”中獲得優(yōu)勝，某日卻被在比賽中認(rèn)識(shí)的一個(gè)奇怪的女子追趕，因緣際會(huì)地進(jìn)入了異界王所統(tǒng)治的時(shí)空中，在那里和他一樣來(lái)到異世界的被稱(chēng)為“核之光主”的其它少年少女們聚集起來(lái)，在六個(gè)不同的世界中旅行，他們將透過(guò)能夠?qū)嶓w化的“Battle Spirits”，與異界王的強(qiáng)大手下們戰(zhàn)斗。最終會(huì)是誰(shuí)能夠打倒異界王，成為最強(qiáng)者呢？