該片的舞臺是私立學院學員高等部，主人公是對謎題十分著迷并自信逢謎必破的高一學生大門界人。 有一天，大門界人受到學生會長邀請，同青梅竹馬少女野葉一起前往學校附近的遺跡解“不能解開之謎”，原來這是一個由神秘智能集團制造出的能危機人類生命的“賢者之謎”。可是熱愛解謎的大門硬要作出挑戰。在得到某件“物件”之后，大門即被點名成為所謂的“解答者”。 從此，大門界人就與野葉和其他充滿個性的解答者一起挑戰潛藏于世界各地的“賢者之謎”。